Procesador automático de informes médicos

El acceso a la información y su intercambio es vital en el ámbito médico, tanto en la investigación como en la gestión hospitalaria. Gran parte de esta información está contenida en informes médicos escritos en lenguaje natural y, por tanto, no es fácilmente tratable por sistemas automáticos. Esta memoria describe el proyecto de fin de carrera "Procesador automático de informes médicos", cuya finalidad es la creación de un sistema de detección de conceptos y términos médicos, representados mediante SNOMED CT, una terminología clínica de referencia. Además, y previamente a dicha extracción de conceptos, se realizan tareas de corrección ortográfica, detección y desambiguación de acrónimos y detección de negaciones. Para la construcción de esta serie de fases, se han aplicado técnicas de procesamiento de lenguaje natural a informes médicos en castellano. Esto supone un reto, dado que la mayoría del trabajo realizado en este campo se ha realizado para lengua inglesa y los recursos para el español son bastante limitados. Todo esto se integra en una herramienta que sirve para procesar automáticamente informes médicos y generar una representación conceptual de su contenido, útil para la gestión de dichos informes en el ámbito clínico-sanitario. Adicionalmente, se han construido dos sistemas auxiliares para medir la eficacia de la aplicación que permiten etiquetar manualmente informes para construir un corpus de informes anotados y usar dicho corpus para evaluar los resultados del procesamiento automático. [ABSTRAC] Accessing to and exchanging information is vital in medical settings, be it in research or in healthcare management. Most of this information is contained in clinical reports written in natural language free text and, therefore, it cannot be easily processed by automatic systems.This document describes our final degree project, “Procesador autom´atico de infor- mes m´edicos”, and its objective, which is the creation of a medical concept extraction system that maps texts to SNOMED CT (a standard reference terminology). Moreover, to prepare the text for the concept detection, several other tasks are performed: spelling correction, acronym detection and disambiguation, and negation detection. In order to build the different parts of the application, we have applied natural language processing techniques to clinical reports in Spanish. This poses a challenge, given that most of the work done in this field deals with texts in English and theavailable resources are rather limited. The previously described tasks are implemented in a software that automatically process medical texts, generates a conceptual representation from their contents and serves as an example of a useful application to manage clinical reports in healthcare and research settings. Furthermore, we have built two auxiliary systems to measure the effectiveness of our tool, which allow to manually tag reports to build an annotated corpus and to use such corpus to evaluate the results of the automatic processing

Encapsulamiento de meristemas de papa (Solanum tuberosum) para la crioconservación y la propagación en invernadero.

Proyecto de Graduación (Bachillerato en Ingeniería en Biotecnología) Instituto Tecnológico de Costa Rica, Escuela de Biología, 2002.La tecnología de la semilla sintética consiste en el encapsulamiento de un explante meristemático para su cultivo in vitro o en condiciones directamente in vivo. Esta tecnología aumenta la protección del material vegetal y facilita su manipulación, por lo que es utilizada, adicionalmente, para la conservación de germoplasma a largo plazo o crioconservación. El objetivo de este proyecto fue la evaluación del encapsulado de meristemas en una especie de importancia económica como la papa (Solanum tuberosum). En los ensayos de crioconservación se obtuvo la relación entre el tiempo de incubación en la solución vitrificadora PVS2 mod. y el porcentaje de sobrevivencia de los meristemas encapsulados. No obstante, será necesario realizar ensayos adicionales para optimizar el protocolo de crioconservación de los meristemas encapsulados de papa. En las pruebas de propagación de las semillas sintéticas a condiciones de invernadero se determinó que las características propias del explante (tamaño y calidad) así como la humedad del sustrato fueron factores imprescindibles para una adecuada sobrevivencia y desarrollo de las plántulas. Se determinó que la esterilización del sustrato aumentó el porcentaje de sobrevivencia de los meristemas encapsulados y que la fertilización periódica acrecentó la vigorosidad de las plántulas

Propuesta de definición de un estándar para la documentación de procesos y rediseño de los procesos de toma de pedido y entrega de pedido. Caso: Grupo INTECA.

Trabajo Final de Graduación (Licenciatura en Administración de Tecnología de Información) Instituto Tecnológico de Costa Rica, Área Académica de Administración de Tecnologías de Información, 2018.Una cadena de suministro está formada por procesos que buscan cubrir las necesidades de los clientes, por lo tanto, estos deben tener como objetivo lograr la mayor satisfacción al momento de entregar el servicio, sin dejar de lado la alineación entre los procesos que conforman la cadena con la estrategia de la organización. La alineación, entre los procesos y la estrategia, es importante, porque conlleva a la realización de los objetivos estratégicos propuestos. En caso de que no exista esa alineación, una de las soluciones que las buenas prácticas proponen es realizar un rediseño de estos. El rediseño de procesos no contribuye únicamente con la alineación, sino que por medio de la aplicación de la metodología BPM, permite la identificación de situaciones que afectan la ejecución. Las actividades que contempla la metodología son: identificar, analizar, rediseñar, coordinar y monitorear los procesos. Esta metodología permite lograr una mejora continua y, gracias a la identificación de problemas, permite proponer soluciones basadas en buenas prácticas que favorecen a la organización, entre ellas está la formulación de indicadores claves de desempeño y la propuesta de un estándar para la documentación de procesos.A supply chain is a process that seeks to meet the needs of customers, therefore, they must aim to achieve the highest satisfaction at the time of delivering the service, without leaving a side, that it most exist an alignment between the processes that make up the chain with the strategy of the organization The alignment, between the processes and the strategy is important, since it entails the realization of the proposed strategic objectives. In the case that this alignment does not exist, one of the solutions that the good practices proposed is to carry out a redesign of these. The redesign of processes not only with the alignment, but through the application of the BPM methodology allows the identification of the situations that affect the execution. The activities contemplated by the methodology are: identify, analyze, redesign, coordinate and monitor the processes. This methodology allows to achieve a continuous improvement and thanks to the identification of problems, allows to propose solutions based on good practices that favors the organization, among them is the formulation of key performance indicators and the proposal of an standard, the for process

Application of an opinion consensus aggregation model based on OWA operators to the recommendation of tourist sites

Given the growth in tourism online data as a result of a large number of users posting their personal opinions in social networks and other online platforms with the idea to help other visitants, many authors have proposed a huge variety of ways to classify the sentiments contained in these opinions in order to recommend services (hotels, restaurants, etc.) and destinations to the users with the intention of facilitating their trip planning. In this paper, the authors propose a model to rank tourist sites of a city, based on OWA operators, with the objective of being used as a recommender system.The authors would like to acknowledge the financial support from the EU project H2020-MSCA-IF-2016- DeciTrustNET-746398. This paper has been elaborated with the financing of FEDER funds in the Spanish National research project TIN2016-75850-R

Savana: Un Entorno Integral de Extracción de Información y Expansión de Terminologías en el Dominio de la Medicina

Terminological databases constitute a fundamental source of information in the medical domain. They are used daily both by practitioners in the area, as well as in academia. Several resources of this kind are available, e.g. CIE, SnomedCT or UMLS (Unified Medical Language System). These terminological databases are of high quality due to them being the result of collaborative expert knowledge. However, they may show certain drawbacks in terms of faithfully representing the ever-changing medical domain. Therefore, systems aimed at capturing novel terminological knowledge in heterogeneous text sources, and able to include them in standard terminologies have the potential to add great value to such repositories. This paper presents, first, Savana, a Biomedical Information Extraction system which, combined with a validation phase carried out by medical practitioners, is used to populate the Spanish branch of SnomedCT with novel knowledge. Second, we describe and evaluate a system which, given a novel medical term, finds its most likely hypernym, thus becoming an enabler in the task of terminological database enrichment and expansion.Las bases terminológicas médicas constituyen una fuente de información fundamental en el dominio médico, ya que son utilizadas a diario tanto por profesionales en el sector como en el ámbito académico. Existen numerosos recursos de este tipo, tales como la Clasificación Internacional de Enfermedades (CIE), SnomedCT, o UMLS (Unified Medical Language System). La calidad de estas bases terminológicas es en general alta, dado que están construidas manualmente por expertos. Sin embargo, su capacidad para representar fielmente un dominio como el médico, que se encuentra en constante evolución, es limitada. Por tanto, el desarrollo de sistemas capaces de capturar nuevo conocimiento en fuentes textuales heterogéneas e incluirlas en terminologías estándar tienen el potencial de añadir un gran valor añadido a dichas terminologías. Este artículo presenta, en primer lugar, Savana, un sistema de extracción de información biomédica que, combinado con validación por parte de profesionales médicos, es utilizado para popular la rama española de SnomedCT con nuevo conocimiento. En segundo lugar, describimos y evaluamos un sistema que, dado un término médico nuevo, le asigna su hiperónimo más probable, constituyendo así un facilitador en tareas de enriquecimiento y expansión de bases terminológicas médicas.This work is partially funded by the Spanish Ministry of Economy and Competitiveness under the following sponsorships: Maria de Maeztu Units of Excellence Programme (MDM-2015-0502), and TUNER project (TIN2015-65308-C5-5-R, MINECO/FEDER, UE)

Leveraging Users’ Trust and Reputation in Social Networks

In on line communities, where there is a huge number of users that interact under anonymous identities, it has been observed that e-word of mouth is a very powerful influence tool. So far, this technology is well known in on-line marketplaces, such as Amazon, eBay or travel based platforms like Tripadvisor or Booking. However, these trust based approach can be leverage in other scenarios from e-democracy to trust based recommendations on e-health context and e-learning systems. The purpose of this contribution is to analyse the main existing trust and reputation mechanisms and to point out new research challenges that needs to be accomplished with the objective of fully exploiting these systems in real world on-line communities.The authors would like to acknowledge the financial support from the EU project H2020-MSCA-IF-2016- DeciTrustNET-746398 and FEDER funds provided in the Spanish project TIN2016-75850-P

Dynamics of Scalar Field Dark Matter With a Cosh-like Potential

The dynamics of a cosmological model fueled by scalar field dark matter with a cosh-like potential plus a cosmological constant is investigated in detail. It is revealed that the late-time attractor is always the de Sitter solution, and that, depending on the values of the free parameters, the oscillating solution of the scalar field -- modeling cold dark matter -- mediates between some early stage (say, the radiation-dominated solution) and the accelerating de Sitter attractor.Comment: 9 pages, 17 figures, uses RevTe

Clasificación orientada a objetos en fotografías aéreas digitales para la discriminación de usos del suelo

Las técnicas de clasificación tradicionales, basadas en rasgos de la imagen a nivel de píxel, presentan ciertas limitaciones, como lo son la aparición de un característico efecto “sal y pimienta” o su reducida capacidad para extraer objetos de interés. Éstas resultan especialmente problemáticas al aplicarse en imágenes de moderada o alta resolución. Una alternativa a dichos sistemas de clasificación pasa por un proceso previo de segmentación de la imagen. De esta forma se permite el trabajo con la imagen a nivel de objeto, lo cual amplía notablemente la cantidad de información que se puede extraer de la misma. En el presente estudio, el objetivo principal es obtener una clasificación digital de la interfase urbano forestal que pueda ser usada por los servicios contra incendios forestales. Para ello, se ha segmentado y clasificado una imagen aérea digital del sensor DMC, empleando el software eCognition, donde la formación de objetos tiene lugar de forma que la homogeneidad interna se mantiene constante. Los objetos resultantes sirven de base para la posterior clasificación. Se utilizaron fotografías aéreas digitales y datos de 350 parcelas en la provincia de Granada, España, para validar las clasificaciones, consiguiendo una precisión total del 90% y un excelente estadístico Kappa (85%) para la clasificación orientada a objetosTraditional classification techniques, basically pixel-based approaches, are limited. Typically, they produce a characteristic “salt and pepper” effect, and are unable to extract objects of interest. These techniques have considerable difficulties in dealing with the rich information content of medium and high-resolution images. One alternative to these classification systems can be a previous segmentation of the image to be classified. In this way, object-based classification can be performed so that a significant increase on the information that can be extracted is obtained. In the present work, the aim is to obtain a digital classification of wilderness-urban interface areas that can be used by fire management services. To this end, a digital aerial image provided by the DMC sensor was segmented and classified using eCognition software, which allows homogeneous image object extraction. The meaningful image objects obtained were then used for the classification. Segmentation before classification worked out as an efficient image analysis technique, overcoming traditional approaches limitations. Digital aerial photographs and data of 350 plots in Granada, Spain, were used to validate the classifications obtained; the overall classification accuracy of 90% and an excellent Kappa statistic (85%) for the object-based classification, proved the validity of this metho

Algorithms of expert classification applied in quickbird satellite images for land use mapping

The objective of this paper was the development of a methodology for the classification of digital aerial images, which, with the aid of object-based classification and the Normalized Difference Vegetation Index (NDVI), can quantify agricultural areas, by using algorithms of expert classification, with the aim of improving the final results of thematic classifications. QuickBird satellite images and data of 2532 plots in Hinojosa del Duque, Spain, were used to validate the different classifications, obtaining an overall classification accuracy of 91.9% and an excellent Kappa statistic (87.6%) for the algorithm of expert classificatio

Las funciones ejecutivas como predictoras del nivel de pericia en jugadores de baloncesto

Los deportes de interacción se desarrollan en contextos extraordinariamente variables, impredecibles, lo que supone que el nivel de entropía es muy elevado. En estos entornos, donde la toma de decisiones resulta determinante para el éxito deportivo, la participación del ejecutivo central juega un papel fundamental. El objetivo de este estudio fue explorar la importancia que pueden tener las funciones ejecutivas como valor predictivo del nivel de pericia de jugadores de baloncesto. Se evaluaron un total de 34 jugadores de baloncesto masculino, de los cuales 12 pertenecían a un equipo profesional de la liga ACB (M = 25.2 años), 12 a un equipo semiprofesional de liga EBA (M = 20.7 años), y 10 a un equipo amateur de liga regional (M = 22.7 años). Se utilizaron la prueba Design Fluency Test, para la flexibilidad cognitiva y la prueba de interferencia de Stroop, para la capacidad de inhibición. Se encontraron diferencias entre las medias de los jugadores ACB y las de los otros dos grupos, pero no entre semiprofesionales y amateurs. Los resultados muestran una mayor flexibilidad cognitiva de los jugadores de baloncesto profesionales respecto a los jugadores no profesionales pero en cambio no distinguen entre grupos cuando se refiere a la capacidad de inhibición. Teniendo en consideración que la primera de las pruebas mide además memoria de trabajo y capacidad inhibitoria, los resultados en general señalan la importancia de las funciones ejecutivas en el baloncesto y coinciden con los de estudios anteriores que indican que los atletas de élite en comparación con los sub-élite o novatos tienen un rendimiento cognitivo superior, aunque en este caso altamente especializado.Interaction Sports are developed in extremely variable, unpredictable contexts, which means that the level of entropy is very high. In these environments, where decision making is decisive for sporting success, the participation of the central executive plays a key role. The aim of this study was to explore the potential importance of executive functions such as predictive value of the level of expertise of basketball players. A total of 34 men basketball players, of whom 12 belonged to a professional team of the ACB league (M = 25.2 years), 12 a semi-pro team of the EBA league (M = 20.7 years) and 10 of a regional amateur league team (M = 22.7 years) were evaluated. Design Fluency Test was used for cognitive flexibility and Stroop interference test for the inhibitory capacity. Differences between the means of the ACB players and those of the other two groups, but not between semiprofessional and amateurs were found. The results show a greater cognitive flexibility of professional basketball players over non professional players but instead does not distinguish between groups when referring to the inhibitory capacity. Considering that the first test also measures working memory and inhibitory capacity, the overall results point to the importance of executive functions in basketball and are consistent with those of previous studies indicating that elite athletes compared to sub-elite or novice have superior cognitive performance, although in this case highly specialized